Nature:全新致癌机制,相分离驱动异常染色质羧酸,促进癌症发展

2021-12-27 01:33 来源:深圳妇科医院

乳腺癌的发展与基因表示细胞核内质内在无序周边地区(IDR)的DNA所致密切特别。各种细胞核内质(最主要基因表达系数、细胞核器调节剂和RNA紧密结合细胞核内)里的IDR通过液-基质受控(LLPS)演化成结合常为,影响从细胞核器演化成和特质刺激耐受到DNA基因表达的无数生常为更全面。

所谓的液-基质受控(LLPS)是指糅合两个不特别DNA凋亡的更全面。该更全面频发在细胞核核内,并能够演化成不具备各种常为理特特质的域,这些域可以推动乳腺癌,例如急特质帕金森氏症的频发发展。在急特质帕金森氏症里,大分子会细胞核内(NUP98或NUP214)的反复染色形体易位产生了一种所致糅合形体,它常常延续大分子会细胞核内 IDR——苯丙氨酸和丝氨酸甘氨酸(FG)的串联分散每一次数列。然而,IDR如何导致DNA出错调控和频发尚能不清楚。

2021年6月末23日,北肯塔基该大学教堂山分校 Gang Greg Wang 的团队等 Nature 发表了文中:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究课题论文。

该研究课题事实证明相受控是乳腺癌演化成的驱动因素,乳腺癌通过相受控获得凋亡以成立药剂基因表达系数结合常为,这同时大幅提高了它们的DNA组基因表示特质并在裂解更全面里其会所致三维细胞核器结构设计的演化成。该研究课题是最早将相受控与乳腺癌演化成连系起来的研究课题之一。因为在其他恶特质里掩蔽到了完全相同的DNA糅合,撰文里阐述的功能也可以解释其他种类的乳腺癌。

NUP98–HOXA9包含两个细胞核内质基序和一个紧密结合数列。为了研究课题NUP98-IDR在帕金森氏症频发里的抑制作用,研究课题的团队主要用于摇动除了紧密结合数列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们发现,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于严重破坏相-相受控结合形体的化学常为质)处置引人注意。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)细胞核内在形体外演化成液形体结合常为。

为了全面分析报告FG每一次数列对结合常为演化成的浓度特别联和多价特质的重要特质,研究课题的团队制取了含有不同总数FG每一次数列的重组N-IDR细胞核内质。他们发现N-IDR包含38个或36个FG以浓度特别联的方法每一次演化成的液滴,那些包含27个或11个FG的却不能进行相受控。说明了NUP98–HOXA9里的IDR以价依赖和浓度依赖的方法成立LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源结构设计域与DNA紧密结合,导致帕金森氏症频发更全面里的DNA紊乱。接下来,研究课题的团队通过细胞核器免疫沉淀和高通量测序来分析报告IDR介导的相受控对NUP98–HOXA9细胞核器基因表示特质的影响。

结果非同示, N-IDRWT/A9不具备非同着大幅提高的DNA组同类型,而与无监理聚类定义的峰值亚类都是。此外,较宽而密集的;也大幅提高子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和帕金森氏症特别DNA富集。

为了全面分析报告IDR其会的LLPS在嵌合形体细胞核器基因表示里的抑制作用,他们利用了形态学和病理学的方法,事实证明IDR介导的LLPS在大幅提高嵌合基因表达系数基因表示特质多方面的因果抑制作用,特别是在;也大幅提高子样峰处看不到的那些。说明了IDR大幅提高糅合形体的DNA组紧密结合并且大幅提高靶DNA激活。

为了次测试NUP98–HOXA9通过LLPS演化成细胞核器尿素的意志力,研究课题的团队填充了表示N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞核的Hi-C图解,揭示了DNA尿素和拷贝彼此之间的相对特别特质。

为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C带入频率的影响,他们有数了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表示细胞核里500个最强烈的N-IDRWT/A9进占位点彼此之间的相互抑制作用计数。结果非同示,N-IDRWT/A9尿素以基本上与CTCF都是的方法演化成,与相受控驱动功能相反。另外,N-IDRWT/A9抗原尿素重新联接大幅提高子和靶DNA彼此之间的联接,反对了糅合基因表达系数的IDR通过相受控在;也大幅提高子样小分子会和癌DNA彼此之间其会DNA尿素的观点。

综上所述,该研究课题发现NUP98–HOXA9里含有的LLPS活特质IDR对帕金森氏症的频发和药剂DNA表示程序来的激活至关重要。这些效应由IDR的意志力介导:1)大幅提高基因表达系数与DNA组小分子会的紧密结合;2)推动大幅提高子和癌DNA核糖体彼此之间的长距离尿素。

该研究课题备有了一个药剂凋亡的原理特质证据,该凋亡在裂解更全面里推动LLPS驱动的基因表达系数紧密结合和3D细胞核器重组。由于含IDR的LLPS活特质分子会与普遍的乳腺癌有关,该研究课题阐述的功能也可以解释其他种类的乳腺癌。

原始典故:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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